В целом, если рассматривать процесс продаж, как завершенный, то CRM должна давать возможность, как начать сделку, так ее и завершить, тем более, что все остальные функции достаточно серьезно проработаны. В основном в коробках данные функции реализованы именно как реестры. По поводу нумерации, не во всех компаниях нумерация формируется с начала года, есть такие у которых нумерация непрерывная, поэтому возможно нужен выбор. Также разделение по типам документов "акт", "накладная", "счет-фактура" даст возможность работать в CRM как с товарами, так и услугами при различных системах налогообложения.